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复旦大学上海医学院是国家临床医师分阶段考试试点院校之一。复旦大学上海医学院（原上海医科大学）创建于1927年，创立时名为国立第四中山大学医学院，是中国创办的第一所国立大学医学院，颜福庆出任首任院长。1932年，独立为国立上海医学院，为当时中国唯一的国立医学院。1939年，因抗战爆发内迁至云南昆明。1940年，辗转迁至四川重庆。1946年，抗战胜利，迁回上海。1952年，更名为“上海第一医学院”。1959年，被定为全国16所重点高等学府之一。1985年，更名为“上海医科大学”。2000年，上海医科大学和复旦大学合并办学，组建成为新的复旦大学。2011年，新的上海医学院成立，作为复旦大学党政的派出机构，根据学校的授权，在大医口的人才培养、科学研究、学科建设、发展规划、资源配置、对外交流等方面，行使相对独立的管理权限。